You may try to use yii2tech/crontab extension for this:

use yii2tech\crontab\CronJob;
use yii2tech\crontab\CronTab;

$cronJob = new CronJob();
$cronJob->min = '0';
$cronJob->hour = '0';
$cronJob->command = 'php /path/to/project/yii some-cron';

$cronTab = new CronTab();
$cronTab->setJobs([
    $cronJob
]);
$cronTab->apply();